Напомним, Разаков был задержан с поличным 4 июля 2008 года. Согласно данным следствия, взятка в размере более 1 миллиона рублей предназначалась Ущиповскому взамен на освобождение Дзахкиева из-под стражи. По мнению нынешнего адвоката Дзакхиева Тамары Амхадовой, которое приводит газета «Время новостей», на самом деле речь шла о вымогательстве со стороны следствия. По ее словам, в мае прошлого года Дзакхиев в СИЗО подвергался сильному моральному и физическому давлению. Поскольку никаких реальных доказательств вины Дзакхиева нет и не было, следователи якобы требовали от него признания. Затем следователи вышли на его адвоката Магомеда Разакова и дали понять, что издевательства над его клиентом могут прекратиться, но за это нужно заплатить.
Кроме того, Дзакхиев предъявлял следствию алиби по поводу подрыва экспресса: якобы в это время он находился в Саранске. Однако допрошенный в качестве свидетеля Ущиповский дезавуировал его слова. «Указанные лица алиби не подтвердили», — сказал он.
В свою очередь Ущиповский во время допроса в качестве свидетеля заявил, что, со слов оперативных сотрудников, Разаков угрожал расправой ему и работавшему с ним по делу старшему оперуполномоченному Департамента по борьбе с терроризмом МВД Валерию Моргуну, а также их семьям. Суд принял во внимание это заявление и счел необходимым, чтобы члены следственной группы по делу о подрыве «Невского экспресса» и их семьи были взяты под госзащиту. Таковая гарантируется российским законодательством.
Что касается собственно теракта, совершенного 13 августа 2007 года, то по подозрению в причастности к нему в октябре того же года были задержаны жители Ингушетии Дзахкиев и Макшарип Хидриев. Согласно версии следствия, они приобрели и доставили в Малую Вишеру взрывчатку, а организатор преступления, имя которого официально не называется (но неофициально озвучено, что им является находящийся в международном розыске некто Павел Косолапов), изготовил устройство и установил его.
Дзахкиеву и Хидриеву предъявлены обвинения в совершении террористического акта, умышленном причинении вреда здоровью средней тяжести и в незаконном приобретении, передаче и перевозке взрывчатых веществ организованной группой. Максимальный срок наказания по этим обвинениям составляет до 20 лет лишения свободы.